Μέριμνα του Υγειονομικού Τμήματος είναι η διασφάλιση της Δημόσιας Υγείας και Καθαριότητας μέσω συστηματικής εποπτείας των δημοτικών ορίων του Αγίου Αθανασίου σε θέματα που επηρεάζουν την ασφάλεια, την υγεία, την ευημερία και την ποιότητα ζωής των δημοτών. Από τον Φεβρουάριο του 2011 έχει παραχωρηθεί στο Υγειονομικό Τμήμα του Δήμου Αγίου Αθανασίου εξουσιοδότηση από το Τμήμα Ιατρικών Υπηρεσιών και Υπηρεσιών Δημόσιας Υγείας του Υπουργείου Υγείας για διεξαγωγή Επισήμων Ελέγχων Τροφίμων και Υποστατικών Τροφίμων στα δημοτικά όρια του Αγίου Αθανασίου. Επιπρόσθετα θα διενεργούνται δειγματοληψίες τροφίμων από διάφορα σημεία πώλησης και αποθήκευσης με βάση το Εθνικό Πρόγραμμα Δειγματοληψίας, καθώς επίσης και Δειγματοληψίες πόσιμου νερού για μικροβιολογικό έλεγχο με βάση το ετήσιο πρόγραμμα δειγματοληψίας του δήμου σε συνεργασία με το Κρατικό Χημείο.

Το Υγειονομείο είναι υπεύθυνο για:
• Την υγιεινή του περιβάλλοντος (έλεγχος αποχετεύσεων, εντόμων, σκυβάλων, εστιών συγκέντρωσης ακαθαρσιών και άλλων ανθυγιεινών καταστάσεων, διερεύνηση παραπόνων για οχληρία,κλπ).
• τον έλεγχο τροφίμων και υδατοπρομηθειών.
• την επιθεώρηση δημοσίων και ιδιωτικών υποστατικών σχετικά με την υγειονομική τους κατάσταση (υποστατικά παρασκευής και πώλησης τροφίμων, κέντρα αναψυχής, καφενεία, σχολεία, κολυμβητικές δεξαμενές κλπ) και την έκδοση υγειονομικών πιστοποιητικών / βεβαιώσεων για την υγειονομική τους κατάσταση και την έκδοση αδειών πώλησης οινοπνευματωδών ποτών και αδειών λειτουργίας.
• τη διερεύνηση και λήψη μέτρων για παρεμπόδιση της μετάδοσης μολυσματικών ασθενειών, την καταπολέμηση εντόμων και τρωκτικών επιβλαβών για την υγεία του ανθρώπου.
• τη διαφώτιση των δημοτών για θέματα δημόσιας και περιβαλλοντικής υγείας.
• την οργάνωση και έλεγχο της συλλογής των σκυβάλων, καθαρισμού των δρόμων, πεζοδρομίων και όλων των ανοικτών χώρων, καθώς και εξασφάλιση και διατήρηση της γενικής καθαριότητας του δήμου.
• την οργάνωση και επίβλεψη εργασιών στον χώρο απόρριψης σκυβάλων.
• την εξέταση από υγειονομικής πλευράς αιτήσεων για την έκδοση πολεοδομικών αδειών, αδειών οικοδομής και διαχωρισμού οικοπέδων.
• έκδοση και φροντίδα για την επίδοση εξωδίκων, ειδοποιήσεων και γραπτών καταγγελιών.
• επίλυση παραπόνων για θέματα που αφορούν τον Υγειονομικό Κλάδο.
• εφαρμόζει ή/ και βοηθά στην εφαρμογή του περί Δήμων Νόμου και των Δημοτικών Κανονισμών ως και άλλων νομοθεσιών σχετικών με τα καθήκοντα του.
• την εγγραφή και έκδοση άδειας κατοχής σκύλου, καθώς και με την εφαρμογή του Περί Σκύλων Νόμου.